Showing GR-Card for GR00178: Crohn's disease (HGVRS1915)
Record Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Version | 1.0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Creation Date | 2019-04-04 18:01:11 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Updated | 2020-04-06 20:49:08 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GWAS-ROCS ID | GR00178 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Study Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Condition/Phenotype | Crohn's disease | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GWAS Central Data Set ID | HGVRS1915 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PubMed ID | 22412388 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Meta-Analysis (Yes/No) | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Control Subjects | 4381 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Case Subjects | 1708 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SNPs |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Simulated Population | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ROC Plot | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AUROC | 0.641743 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Logistic Regression Equation | log(p/(1 - p)) = 3.219 + 0.641(rs3091316) - 1.843(rs2076756) - 0.317(rs7705924) + 1.700(rs3091338) - 0.886(rs2241880) - 16.409(rs11190141) + 0.046(rs11229030) + 15.974(rs7076156) - 0.078(rs6545946) - 0.225(rs10734105) + 1.154(rs13003464) - 1.279(rs9292777) + 0.006(rs11574514) + 0.552(rs9258260) - 2.159(rs11209026) + 1.340(rs12677663) - 0.801(rs1906493) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Heritability | 0.080 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regression Type | OLS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Download File | GR00178.csv |